Mặt khác, khi thực hiện hợp đồng, không tuân thủ đúng các quy định, sai với quyết định phê duyệt như: chia gói thầu để thực hiện hợp đồng; hợp đồng không ràng buộc bảo đảm thực hiện hợp đồng hoặc có ràng buộc nhưng không thực hiện. Có mặt hàng thay đổi nước sản xuất; tăng, giảm số lượng; không tài liệu chứng nhận chất lượng, xuất xứ hàng hóa...
Điều đáng nói, 3 gói thầu mua sinh phẩm của Công ty Việt Á sản xuất, công tác lập, trình dự toán và kế hoạch lựa chọn nhà thầu có dấu hiệu thiếu minh bạch; vi phạm các quy định trong khâu lập kế hoạch và thực hiện hợp đồng.
Trước những sai phạm nghiêm trọng nêu trên, Thanh tra tỉnh Bạc Liêu đã báo cáo Thường trực Tỉnh ủy và Ủy ban nhân dân tỉnh Bạc Liêu, Thường trực Tỉnh ủy Bạc Liêu đã yêu cầu Thanh tra tỉnh chuyển toàn bộ hồ sơ 3 gói thầu mua sinh phẩm, hóa chất, vật tư y tế liên quan Công ty Việt Á (do CDC Bạc Liêu làm chủ đầu tư) sang Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Bạc Liêu điều tra, làm rõ, xử lý nghiêm minh đúng người, đúng tội theo pháp luật.
Trước đó, ông Trần Vĩnh An, Giám đốc CDC Bạc Liêu nhiều lần tuyên bố, khẳng định: “Tôi còn không biết Công ty Việt Á ở đâu, không gặp nhân viên nào và không có phần trăm hoa hồng gì…”.